Les espèces de ruminants domestiques et les porcins voient leur gestion régie par les articles du titre V du livre VI du code rural. À ce titre, l'organisation de la gestion des races repose sur des associations d'éleveurs ayant chacune un rôle spécialisé dans la collecte :
- des informations zootechniques de parenté (état-civil),
- des différentes aptitudes fonctionnelles ou de production des animaux,
- de la gestion des informations ci-dessus pour aboutir au calcul de la valeur génétique des animaux à l'issu de leur mise à l'épreuve dans différents dispositifs d'évaluation.
Cette organisation reconnait pour les ruminants des organismes départementaux pour le recueil de performances et la mise en place de semences, des organismes régionaux pour le traitement des données ou pour la mise à l'épreuve et la production de semence des reproducteurs mâles. Des organismes nationaux sont disponibles pour les ruminants et les porcins afin de calculer les index de valeur génétique, de produire et de mettre à jour des protocoles techniques et d'encadrer le dispositif dans sa globalité : Institut de l'Élevage pour les ruminants et Institut Technique du Porc pour les porcins.
Ces espèces bénéficient depuis les années 70 d'un budget consacré à la gestion des races à petit effectif (0,5% du budget de la sélection animale pour les ruminants et les porcins). Ce financement géré par l'Institut Technique correspondant, permet de suivre des programmes de gestion chez les bovins et quelques races ovines, ainsi que pour toutes les races porcines à petit effectif.
La gestion des espèces de volailles et de lapin n'est pas inscrite au code rural. Il n'y a pas formellement de structure nationale en charge du support technique pour l'amélioration génétique de ces espèces. L'INRA aide les firmes de sélection et l'ITAVI (Institut Technique en Aviculture), leur prodigue une aide en ce qui concerne l'alimentation des animaux, la conduite des élevage, etc. Pour les volailles, le SYSAAF (Syndicat des Sélectioneurs Avicoles et Aquacoles Français) tient un rôle d'appui technique génétique. Les races à petit effectif ne sont maintenues que par la détermination de quelques éleveurs regroupés en associations de races, elles même fédérées au sein de la Fédération Française des Volailles puis de la Société Centrale d'Aviculture Française.
